1539 (MDXXXIX) adalah tahun biasa yang diawali hari Rabu dalam kalender Julian, tahun ke-1539 dalam sebutan Masehi (CE) dan Anno Domini (AD), tahun ke-539 pada Milenium ke-2, tahun ke-39 pada Abad ke-16, dan tahun ke- 10 dan terakhir pada dekade 1530-an. Mulai awal tahun 1539, kalender Gregorian terhitung 10 hari setelah kalender Julian, yang merupakan kalender dominan pada saat itu.
Peristiwa
- Aceh menyerang suku Batak.
- Yohanes Calvin, teolog Kristen Prancis, menikah dengan Idelette de Bure.
- 14 Januari - Spanyol menganeksasi Kuba.
Kematian
- 22 September - Guru Nanak Dev, guru pertama Sikhisme (lahir 1469).