Árið 1546 (MDXLVI í rómverskum tölum) var 46. ár 16. aldar og almennt ár sem hófst á föstudegi samkvæmt júlíska tímatalinu.
Á Íslandi
- Þorleifur Pálsson lét af störfum sem lögmaður norðan og vestan.
- Landskjálfti um fardaga, mestur í Ölfusi, Hús hrundu víða. Allt Hjallahverfi hrapaði.
- Tómas Eiríksson varð ábóti í Munkaþverárklaustri.
- Fædd
Dáin.
- Jón Finnbogason, príor í Möðruvallaklaustri.
- Pétur Pálsson, ábóti í Munkaþverárklaustri.
Erlendis
- 15. febrúar - Marteinn Lúther hélt síðustu ræðu sína, um þrjóska gyðinga sem ætti að reka burt frá þýsku svæði.
- 8. mars - Jóhannes 4., konungur Portúgal, gaf út skipun fyrir portúgalska Indland um að banna hindúisma. Uppreisn hófst í Gújarat sem bæld var niður í nóvember.
- 28. ágúst - Heilaga rómverska ríkið réðst inn í Frankfurt en var hrakið burt af mótmælendatrúmönnum.
- 8. október - Húgenottar voru brenndir á báli í Frakklandi fyrir villutrú (mótmælendatrú).
- 8. nóvember - Majar gerðu uppreisn gegn Spánverjum á Júkatan.
- Michelangelo var skipaður hönnuður Péturskirkjunnar í Róm.
- Fædd
- 14. desember – Tycho Brahe, danskur stjörnufræðingur (d. 1601).
- Dáin
- 18. febrúar – Marteinn Lúther, þýskur guðfræðingur og munkur (f. 1483).
