Персийците започват решително настъпление по суша и вода срещу центъра на въстанието, Милет. Всички техни сили на запад от река Халис са обединени в една войска, а в кампанията е включен и главния им флот от 600 триреми
Йонийците решават да оставят отбраната на Милет на неговото население и да концентрират флота си при остров Ладе.
През есента персийският флот нанася съкрушително поражение на йонийския флот в битката при Ладе, а Милет е обсаден и впоследствие превзет. Остатъчните огнища на съпротива са потушени.